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郭雨珍

副教授

招生学科专业:
数学 -- 【招收硕士研究生】 -- 数学学院

毕业院校:大连理工大学

学历:大连理工大学

学位:理学博士学位

所在单位:理学院

办公地点:理学院361

联系方式:guoyuzhen@nuaa.edu.cn

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利用粒子群算法在菱形网格上预测蛋白质结构(英文)

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所属单位:理学院

发表刊物:生物信息学

关键字:蛋白质结构预测;最优化模型;粒子群算法;调整策略;

摘要:本文在菱形网格上研究讨论了二维HP模型。首先,将蛋白质结构预测问题转化成一个数学问题,并简化成氨基酸序列中每个氨基酸与网格格点的匹配问题。为了解决这个数学问题,我们改进并扩展了经典的粒子群算法。为了验证算法和模型的有效性,我们对一些典型的算例进行数值模拟。通过与方格网上得到的蛋白质构象进行比较,菱形网上的蛋白质构象更自然,更接近真实。我们进一步比较了菱形网格上的紧致构象和非紧致构象。结果显示我们的模型和算法在菱形网格上预测氨基酸序列的蛋白质结构是有效的有意义的。

是否译文:

发表时间:2017-06-19

合写作者:陶凤英

通讯作者:郭雨珍

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